Каким образом можно вынести настройки запросов JPA в внешний файл, при этом сохранив работу репозитория?

В JPA можно вынести настройки запросов (например, именованные запросы) в внешний файл XML, чтобы не хранить их непосредственно в аннотациях репозитория или сущностей. Это позволяет централизованно управлять запросами и упрощает их изменение без перекомпиляции кода.

Для этого:

1. Создайте XML-файл (например, orm.xml) с описанием именованных запросов:

<entity-mappings xmlns="http://xmlns.jcp.org/xml/ns/persistence/orm"
                 xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance"
                 xsi:schemaLocation="http://xmlns.jcp.org/xml/ns/persistence/orm
                 http://xmlns.jcp.org/xml/ns/persistence/orm_2_1.xsd"
                 version="2.1">
    <named-query name="User.findByName">
        <query>SELECT u FROM User u WHERE u.name = :name</query>
    </named-query>
</entity-mappings>

2. Укажите этот файл в persistence.xml:

<persistence-unit name="myUnit">
    <mapping-file>META-INF/orm.xml</mapping-file>
    <!-- другие настройки -->
</persistence-unit>

3. В репозитории используйте именованные запросы как обычно, например, через @Query(name = "User.findByName").

Таким образом, репозиторий продолжит работать, а запросы будут вынесены в отдельный конфигурационный файл.