Какая конфигурация будет иметь приоритет: XML, Java или аннотации?

Порядок приоритета конфигурации в Spring (от низшего к высшему, переопределяя предыдущие):

1. XML-конфигурация
2. JavaConfig
3. Аннотации (например, @Component, @Autowired, @Value, @Primary, @Qualifier)

Таким образом, аннотации имеют наивысший приоритет и могут переопределять конфигурацию, заданную в XML или JavaConfig. Аннотации на уровне элементов (полей, методов, параметров) имеют более высокий приоритет, чем аннотации на уровне классов.