Может ли сложиться ситуация, когда контроллер отсутствует в контексте?

Да, такая ситуация возможна. Это происходит, если:

• Контроллер не помечен соответствующей аннотацией (@Controller, @RestController).
• Пакет, в котором находится контроллер, не включен в конфигурацию сканирования компонентов (@ComponentScan или XML-аналоги).
• При использовании XML-конфигурации контроллер не объявлен как бин.
• Влияние других конфигураций (например, Security), которые могут блокировать инициализацию или доступ к определенным бинам.
• Ошибка при инициализации самого контроллера или его зависимостей.
• Использование кастомных BeanFactoryPostProcessor или BeanPostProcessor, которые могут влиять на процесс создания и регистрации бинов, потенциально исключая контроллер.