É possível aplicar restrições no Auto Layout a partir de threads diferentes do thread principal?

Não, fazer alterações nas restrições do Auto Layout deve ser feito apenas a partir do thread principal. UIKit não é seguro para threads, e quaisquer operações com a interface, incluindo a alteração de restrições, devem ser feitas no thread principal para evitar comportamentos imprevisíveis e falhas.

Se precisar atualizar restrições a partir de uma thread em segundo plano, deve mudar para o thread principal, por exemplo, usando:

DispatchQueue.main.async {
    // atualização das restrições do Auto Layout
}

Isso garante o funcionamento correto da interface.