Décrivez votre expérience dans le développement de systèmes pour l'analyse et l'interprétation des données génomiques.

В разработке систем для анализа и интерпретации геномных данных я работал с обработкой больших объемов последовательностей ДНК и РНК, используя библиотеки Python, такие как Biopython и pandas для анализа данных. Основные задачи включали фильтрацию, выравнивание последовательностей, поиск мутаций и аннотацию генов. Например, я создавал скрипты для парсинга файлов формата FASTQ и VCF, а также визуализации результатов с помощью matplotlib.

Пример кода для чтения FASTQ файла с использованием Biopython:

from Bio import SeqIO

for record in SeqIO.parse("sample.fastq", "fastq"):
    print(f"ID: {record.id}")
    print(f"Sequence: {record.seq}")
    print(f"Quality: {record.letter_annotations['phred_quality']}")

Также имел опыт интеграции таких систем с базами данных для хранения и быстрого поиска геномных данных.