Les protocoles de couche application fonctionnant sur TCP incluent HTTP, HTTPS, FTP, SMTP, POP3, IMAP, SSH et bien d'autres. Ils assurent une transmission fiable des données avec établissement de connexion.

Les protocoles fonctionnant sur UDP sont généralement utilisés lorsque la vitesse et la faible latence sont importantes, et non la livraison garantie. Ils incluent DNS, DHCP, TFTP, SNMP, RTP (pour l'audio/vidéo en streaming).

Ainsi, le choix du protocole dépend des exigences en matière de fiabilité et de vitesse de transmission des données.

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