¿Se llamará al método anotado con @PostConstruct en un Spring Bean configurado con Scope de prototipo?

Да, метод, аннотированный @PostConstruct, будет вызван у Spring Bean с прототипным скоупом. В Spring для бинов с прототипным скоупом жизненный цикл инициализации (включая вызов методов с @PostConstruct) происходит при создании каждого экземпляра бина. Однако Spring не управляет полным жизненным циклом прототипных бинов (например, не вызывает методы @PreDestroy), так как ответственность за уничтожение таких бинов лежит на вызывающем коде.