¿Dónde almacena las bibliotecas de CocoaPods en su proyecto?

Por lo general, en el directorio Pods, que se crea automáticamente en la raíz del proyecto después de la primera instalación de dependencias (pod install).

Ejemplo de estructura:

YourProject/
├── YourProject.xcodeproj/
├── YourProject/
├── Podfile
├── Podfile.lock
└── Pods/  // Aquí se almacenan todas las bibliotecas instaladas
    ├── Headers/
    ├── Local Podspecs/
    ├── Manifest.lock
    ├── Pods.xcodeproj  // Proyecto CocoaPods con todas las bibliotecas
    ├── <Library1>/
    ├── <Library2>/
    └── ...

La carpeta Pods generalmente se agrega a .gitignore para no rastrear sus cambios en el sistema de control de versiones, ya que puede ser fácilmente reproducida con pod install.