¿Afecta esto al archivo original asociado al realizar cambios en el hardlink?

Жёсткая ссылка (hardlink) — это альтернативное имя для одного и того же файла в файловой системе. При изменении содержимого файла через любую из жёстких ссылок, изменения отражаются во всех остальных, так как они указывают на один и тот же inode (физический объект на диске).

То есть, если вы изменяете файл через hardlink, вы фактически меняете исходный файл, и все другие hardlink будут показывать эти изменения.