Je povinné psát v kódu samostatnou třídu, pokud jsou všechny nastavení zadána přes XML?

Нет, писать отдельный класс не обязательно, если все настройки заданы через XML. В Java, особенно при использовании Spring Framework, конфигурация через XML позволяет определить бины и их зависимости без необходимости создавать дополнительный класс-конфигуратор. Однако, если требуется более динамическая или программная конфигурация, то создание класса с аннотациями (@Configuration) может быть удобнее и гибче.